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egrace479/Butterfly-Sample

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Hugging Face2024-04-26 更新2024-06-12 收录
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资源简介:
该数据集是用于Imageomics Data Training Workshop的图像子集,并对元数据进行了修改,主要用于教学目的。图像和元数据最初来源于Hoyal Cuthill等人2019年的研究,涉及蝴蝶表型的深度学习研究。元数据在此版本中已从原始来源修改,并且图像文件名也已更改。

该数据集是用于Imageomics Data Training Workshop的图像子集,并对元数据进行了修改,主要用于教学目的。图像和元数据最初来源于Hoyal Cuthill等人2019年的研究,涉及蝴蝶表型的深度学习研究。元数据在此版本中已从原始来源修改,并且图像文件名也已更改。
提供机构:
egrace479
原始信息汇总

Sample Butterfly Dataset 概述

数据集来源

  • 原始数据来源
    • Hoyal Cuthill, Jennifer F. et al. (2019), Data from: Deep learning on butterfly phenotypes tests evolution’s oldest mathematical model [Dataset]. Dryad. 链接.
    • Hoyal Cuthill, J.F., Guttenberg, N., Ledger, S., Crowther, R. & Huertas, B. (2019), Deep learning on butterfly phenotypes tests evolution’s oldest mathematical model, Science Advances, 5(8),eaaw4967. DOI:10.1126/sciadv.aaw4967.

数据集说明

  • 用途:本数据集为Imageomics Data Training Workshop使用的图像子集,经过元数据修改,主要用作教学示例。
  • 修改内容:元数据已修改,图像文件名已更改。

许可协议

  • 许可证:MIT
搜集汇总
数据集介绍
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构建方式
在生物信息学领域,蝴蝶表型数据的采集与整理对于进化生物学研究具有重要价值。本数据集源自Hoyal Cuthill等人于2019年发表在《Science Advances》上的研究成果,原始图像与元数据通过Dryad平台公开获取。构建过程中,研究者对原始元数据进行了适应性调整,并统一修改了图像文件名,旨在为图像组学数据训练研讨会提供一个简化的教学示例,而非用于严肃的科研分析。
特点
作为教学导向的数据子集,本数据集聚焦于蝴蝶表型图像,其核心特点在于经过筛选与处理的元数据。图像文件经过重命名以提升一致性,元数据则针对教学场景进行了简化与重构,确保学习者能够直观理解数据结构和内容。尽管规模有限,但数据源自经过同行评议的科学研究,保留了蝴蝶形态学的基本信息,适用于入门级的机器学习与图像分析实践。
使用方法
在图像组学与计算生物学的教学实践中,本数据集可作为示范工具。使用者可通过加载图像文件与配套元数据,进行基础的图像分类、特征提取或数据可视化练习。由于数据经过预处理,建议将其用于算法验证、教学演示或工作坊中的动手操作环节,避免直接应用于实际科研项目,以确保研究结果的严谨性与可靠性。
背景与挑战
背景概述
在计算生物学与进化形态学交叉领域,表型数据的量化分析长期面临技术瓶颈。2019年,由Jennifer F. Hoyal Cuthill等学者联合发布的蝴蝶表型数据集,依托Dryad平台公开,旨在通过深度学习技术验证达尔文提出的最早数学进化模型。该数据集源自《科学进展》期刊的核心研究成果,通过高分辨率蝴蝶翅膀图像及其形态标注,为演化发育生物学提供了可计算的表型基准。其创新性在于将传统生物形态测量转化为可训练的视觉模式,推动了图像组学在进化机制可解释性研究中的范式转移。
当前挑战
该数据集核心挑战在于解决复杂生物形态的量化表征问题:蝴蝶翅膀图案具有高阶对称性、色彩渐变与纹理异质性,传统特征工程方法难以捕捉其进化语义。构建过程中,研究者需克服多源标本图像标准化难题,包括光照校正、姿态对齐与损伤样本修复;同时,表型标注依赖领域专家手工注释,存在主观偏差与尺度不一致风险。此外,原始数据向教学子集的转化需平衡信息完整性,在简化元数据时可能损失进化发育的上下文关联。
常用场景
经典使用场景
在计算生物学与进化形态学领域,蝴蝶样本数据集常被用于图像分类与表型特征提取的模型训练。该数据集通过提供标注清晰的蝴蝶图像,支持研究者构建深度学习模型,以自动识别蝴蝶物种及其形态变异,从而探索生物多样性模式。其经典应用场景包括监督学习框架下的卷积神经网络训练,帮助模型学习从翅膀图案到分类标签的映射关系,为后续的进化分析奠定数据基础。
衍生相关工作
基于该数据集衍生的经典工作包括Hoyal Cuthill等人2019年在《Science Advances》上发表的研究,他们利用深度学习分析蝴蝶表型,检验了进化数学模型的预测能力。这项研究开创了将卷积神经网络应用于进化形态学的新范式,后续工作进一步拓展了表型-基因型关联分析、物种分化模拟等领域,促进了图像组学(Imageomics)这一新兴交叉学科的发展。
数据集最近研究
最新研究方向
在计算生物学与图像组学领域,蝴蝶表型数据集正成为探索进化模型与深度学习交叉研究的关键资源。前沿研究聚焦于利用卷积神经网络解析蝴蝶翅膀的形态特征,以验证达尔文提出的古老数学进化理论,如物种分化与自然选择机制。热点事件包括Imageomics数据训练工作坊的推广,该活动促进了多学科合作,将计算机视觉技术应用于生物多样性保护与进化生物学问题。这类研究的意义在于深化对生物表型可塑性的理解,为物种适应性进化提供数据驱动的实证支持,同时推动人工智能在生态学中的创新应用。
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