A3D Database

In the A3D database, we analyze the AF-predicted human protein structures (for over 20.5 thousand unique Uniprot IDs) in terms of their aggregation properties using the A3D tool. Each entry of the A3D database provides a detailed analysis of the structure-based aggregation propensity computed with A3D. The A3D database implements simple but useful graphical tools for visualizing and interpreting protein structure datasets.

在A3D数据库中，我们借助A3D工具，针对超过20500个唯一UniProt标识符（UniProt ID）对应的AlphaFold（AF）预测人类蛋白质结构，分析其聚集特性。A3D数据库的每条条目均提供了通过A3D工具计算得到的基于结构的聚集倾向的详细分析结果。该数据库配备了简洁实用的可视化工具，用于蛋白质结构数据集的可视化与解读。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

A3D Database是一个专注于人类蛋白质溶解度与聚集性质预测的数据集，基于AlphaFold数据库的结构预测，使用Aggrescan3D（A3D）算法进行分析。该数据集覆盖了人类蛋白质组，包含23,391个预测结构，对应20,504个独特的UniProt条目，并考虑了结构置信度和四级结构上下文以提高预测准确性。数据集提供CSV格式的注释和原始数据下载，便于用户进一步研究。