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中国南方有壳牡蛎(Crassostrea ariakensis)染色体水平基因组组装

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国家海洋科学数据中心2025-08-30 更新2025-05-31 收录
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http://msdc.qdio.ac.cn/data/metadata-special-detail?id=1871843132870594562&otherId=1871843132887371778
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Suminoe牡蛎Crassostrea ariakensis (Fujita, 1913)是最重要的生态和生物之一渔业双壳软体动物,分布于世界各地。在这里,我们报告了提高的质量利用纳米孔对中国南海阿里akensis进行染色体水平的基因组组装Illumina测序技术、高通量染色体构象捕获分析等。 组装后的基因组大小为631.73Mb,其中contig N50长度为5.36Mb, scaffold N50长度为5.36Mb长度为61.15Mb,分配给10条染色体。共预测了29357个蛋白质编码基因,96.68%有功能注释。基因组重复长度为347.11Mb (54.94%)元件和1130个非编码rna。这种改良的基因组组装方法是一种新的遗传进化方法是了解牡蛎多样性和进化的重要资源,并为遗传提供见解牡蛎资源的改进、保护和管理。
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