病原微生物保守特异性区域数据集
收藏湖南省数据知识产权登记平台2025-11-26 更新2026-01-10 收录
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资源简介:
基于物种所有基因组共有的一致性序列,计算序列上每个碱基的保守性。适用于数百种细菌、40+种真菌、30+种病毒、多种寄生虫等类别的病原微生物的200bp以内的保守特异性区域查找和输出,从而便于进行后续单重或多重引物设计工作。
提供机构:
圣湘生物科技股份有限公司
创建时间:
2025-11-26
搜集汇总
数据集介绍

背景与挑战
背景概述
该数据集专注于病原微生物的保守特异性区域,涵盖细菌、真菌、病毒和寄生虫等多种类别,包含超过8.7万条记录,提供物种信息、序列位置、保守性评分等关键字段。它旨在支持引物设计工作,通过输出保守特异性序列、简并序列和屏蔽序列,帮助研究人员精准定位高保守区域并避免非特异性扩增,从而优化分子检测工具的开发。数据集采用自研算法处理,结合保守性、特异性、GC含量等多维度评估,确保区域的高质量和实用性。
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