鼠脑空间转录组与细胞类型注释数据集

动物大脑的基因表达与细胞类型的空间分布信息对于理解大脑的功能至关重要。在这里，我们使用snRNA-seq和Stereo-seq技术，生成了一个单细胞分辨率的鼠脑空间转录组图谱，涵盖29,655个基因，同时提供了308种细胞类型的空间分布信息，涉及超过600万个细胞。我们的研究发现了具有时空特异性的基因和调控单元，并提供了鼠脑中多样化细胞簇的空间分布图。

Spatial distribution information of gene expression and cell types in the animal brain is critical for understanding brain functions. Here, we employed snRNA-seq and Stereo-seq technologies to generate a single-cell resolution spatial transcriptomic atlas of the mouse brain, which covers 29,655 genes, provides spatial distribution data for 308 cell types, and involves over 6 million cells. This study identifies temporospatially specific genes and regulatory units, and presents spatial distribution maps of diverse cell clusters in the mouse brain.

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集是一个大规模鼠脑空间转录组与细胞类型注释资源，基于snRNA-seq和Stereo-seq技术构建，包含29,655个基因的空间表达信息和308个细胞簇的注释，涉及超过600万个细胞，具有单细胞分辨率。数据集提供了鼠脑中时空特异性基因和调控子的发现，以及细胞簇的空间分布图谱，总存储容量达693.44 GB，适用于脑科学研究。