AlgaePath

It is a web-based database integrating gene information, biological pathways, and next-generation sequencing (NGS) datasets derived from Chlamydomonas reinhardtii and Neodesmus sp. UTEX 2219-4. By using Gene Search, Pathway Search, DEGs Search, Gene Group Analysis, and Co-expression Analysis in AlgaePath, users can effectively identify transcript abundance profiles and compare variations among different conditions in a pathway map本数据库为基于网页的集成型数据库，整合了莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii）与新囊藻属（Neodesmus sp.）UTEX 2219-4菌株的基因信息、生物通路数据以及下一代测序（next-generation sequencing, NGS）数据集。用户可借助AlgaePath平台提供的基因检索（Gene Search）、通路检索（Pathway Search）、差异表达基因检索（DEGs Search）、基因组分析（Gene Group Analysis）以及共表达分析（Co-expression Analysis）功能，高效获取转录本丰度谱，并在通路图谱中对比不同实验条件下的样本差异。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

AlgaePath 2.0是一个基于网络的数据库，整合了来自Chlamydomonas reinhardtii和Neodesmus sp. UTEX 2219-4的基因信息、生物通路和下一代测序数据集。该数据库提供基因搜索、通路搜索、差异表达基因分析、富集分析和共表达分析等功能，帮助用户识别转录本丰度谱并在通路图中比较不同条件下的变化。它主要用于支持藻类基因表达研究，通过多种分析工具促进数据探索。