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TarDB is a plant miRNA target repository, which is based on cross-species conservation filter, degradome/PARE-seq, and small RNA-seq data analysis.

TarDB是一款植物微小RNA(microRNA,miRNA)靶标数据库,其构建依托跨物种保守性筛选、降解组/PARE测序(degradome/PARE-seq)与小RNA测序(small RNA-seq)数据分析方法。

提供机构:
天津师范大学
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数据集介绍
TarDB 数据集图片
背景与挑战
背景概述
TarDB是一个植物miRNA靶标数据库,基于跨物种保守性筛选、降解组/PARE-seq和小RNA-seq数据分析构建。它收集了未报告的miRNA靶标和phasiRNA数据,提供浏览和搜索功能,涵盖43种植物物种,包括保守靶标、降解组支持靶标和miRNA触发的phasiRNA位点。
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