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SpeciesInteractions_EID2

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figshare.com2023-05-31 更新2025-03-26 收录
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https://figshare.com/articles/dataset/SpeciesInteractions_EID2/1381853/5
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Species interactions contained in this dataset indicate the possibility of one species (Cargo) having an interaction with another species (Carrier).  This dataset comprises the following fields: 1 Cargo: name of cargo species. 2 Cargo classification: the taxonomic classification of the cargo (e.g. bacteria, virus, etc.) 3 Carrier: name of carrier species. 4 Carrier classification: the taxonomic classification of the carrier (e.g. human, domestic, primates, mammals, etc.) 5 Sequences count: Total number of nucleotide sequences supporting the interaction. 6 Publication count: Total number of PubMed publications supporting the interaction. 7 Sequences: semi colon separated list of the nucleotide sequence identifiers (GIs) that can be used to retrieve these sequences from the NCBI Nucleotide database. For readability purposes this list was restricted to a maximum of 100 identifiers. 8 Publications: semi colon separated list of the PubMed citation identifiers (PMIDs) that can be used to retrieve these publications from the NCBI PubMed database. For readability purposes this list was restricted to a maximum of 100 identifiers.

本数据集包含了物种间相互作用的记录,表明某一物种(货物物种)可能与其他物种(携带物种)存在相互作用的可能性。该数据集包含以下字段: 1 货物:货物物种的名称。 2 货物分类:货物物种的税onomical分类(例如:细菌、病毒等)。 3 携带者:携带物种的名称。 4 携带者分类:携带物种的税onomical分类(例如:人类、家养动物、灵长类动物、哺乳动物等)。 5 序列数量:支持相互作用的核苷酸序列总数。 6 发表数量:支持相互作用的PubMed出版物总数。 7 序列:用分号分隔的核苷酸序列标识符(GIs)列表,可用于从NCBI核苷酸数据库检索这些序列。出于可读性考虑,此列表被限制为最多100个标识符。 8 发表物:用分号分隔的PubMed引用标识符(PMIDs)列表,可用于从NCBI PubMed数据库检索这些出版物。出于可读性考虑,此列表被限制为最多100个标识符。
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