NonTg, PS2APP和TauPS2APP 20-22月龄小鼠海马单细胞转录组测序

Here we studied cellular level changes of hippocampal cells by unbiased single cell RNA-seq using AD mouse models bearing amyloid pathology (PS2APP), or amyloid and tau combined pathology (TauPS2APP) by single cell RNA-seq. We identified 16 different cell types and further characterized responses of microglia, oligodendrocytes, astrocytes and T cells to amyloidosis only and amyloid plus tau combined pathology. Both mouse models exhibited robust microglial responses. We also found distinct responses of oligodendrocytes to different AD pathologies. We observed increased T cell numbers in both mouse models. Current dataset presents diverse transcriptomic responses to AD pathology and provides resources to study molecular mechanisms underlying disease onset and progression.

本研究借助无偏倚单细胞RNA测序（single cell RNA-seq）技术，以携带淀粉样蛋白病理的阿尔茨海默病（Alzheimer's Disease, AD）小鼠模型（PS2APP），以及同时存在淀粉样蛋白与tau蛋白联合病理的AD小鼠模型（TauPS2APP）为研究对象，分析了海马细胞的细胞水平转录组变化。本研究共鉴定出16种不同的细胞类型，并进一步解析了小胶质细胞、少突胶质细胞、星形胶质细胞以及T细胞针对单纯淀粉样蛋白病理，以及淀粉样蛋白与tau蛋白联合病理的应答特征。两款小鼠模型均表现出显著的小胶质细胞应答反应。此外，本研究还发现少突胶质细胞针对不同AD病理类型呈现出差异化的应答特征。同时，两款模型的脑组织中T细胞数量均出现明显升高。本数据集完整呈现了针对AD病理的多样化转录组应答特征，为解析疾病发生与进展的分子机制提供了宝贵的研究资源。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集通过单细胞RNA测序技术，对20-22月龄的NonTg（对照）、PS2APP（淀粉样蛋白病理）和TauPS2APP（淀粉样蛋白和tau联合病理）三种基因型小鼠的海马组织进行了转录组分析，旨在研究阿尔茨海默病病理下的细胞水平变化。研究共识别出16种细胞类型，并详细揭示了小胶质细胞、少突胶质细胞、星形胶质细胞和T细胞在不同病理模型中的特异性反应，为理解疾病机制提供了重要资源。数据集包含11个样本，总数据量约149.9 GB。