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Chig-AIMD_random_test
收藏Mendeley Data2024-04-03 更新2024-06-27 收录
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https://materials.colabfit.org/id/DS_e08dhew7z0r6_0
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资源简介：
Test configurations from the 'random' split of Chig-AIMD. This dataset covers the conformational space of chignolin with DFT-level precision. We sequentially applied replica exchange molecular dynamics (REMD), conventional MD, and ab initio MD (AIMD) simulations on a 10 amino acid protein, Chignolin, and finally collected 2 million biomolecule structures with quantum level energy and force records.
本数据集源自Chig-AIMD的「随机划分」子集，覆盖了模型蛋白Chignolin的构象空间，且精度达到密度泛函理论（Density Functional Theory）级别。研究团队依次对该10氨基酸蛋白Chignolin开展了副本交换分子动力学（Replica Exchange Molecular Dynamics，REMD）、常规分子动力学以及从头算分子动力学（Ab Initio Molecular Dynamics，AIMD）模拟，最终收集得到200万个带有量子级能量与力场记录的生物分子结构。
创建时间：
2024-03-30
搜集汇总
数据集介绍
背景与挑战
背景概述
该数据集包含Chignolin蛋白质的构象空间数据，通过DFT-M06-2X方法计算，包含198,983个构型和33,031,178个原子，主要元素为C、H、N、O。数据集来源于多种分子动力学模拟，提供量子级别的能量和力记录。
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