MNB13耐锰及锰氧化机制

本数据集提供了工程菌株 MNB13 的综合生物学数据，旨在解析其合成 beta-丙氨酸的代谢机制、基因/蛋白表达调控网络以及氧化应激响应机制。数据集整合了基因组学、转录组学、蛋白质组学及生理生化指标数据，支持从多维组学角度系统研究菌株的生产性能与抗逆特性。主要内容包括：
基因组学数据 (Genomics)：
包含 MNB13 菌株的高质量参考基因组序列及注释信息，作为后续组学分析的遗传图谱基础。
提供系统进化树序列文件 (.fas)，用于分析菌株的进化地位及亲缘关系。
转录组学数据 (Transcriptomics)：
提供了菌株在特定发酵或培养条件下的转录组测序结果，用于揭示与 beta-丙氨酸合成相关的关键基因表达变化。
蛋白质组学数据 (Proteomics)：
包含菌株的蛋白质组学分析数据，用于从蛋白水平验证基因表达差异，并探索关键酶的丰度变化对代谢通量的影响。
代谢产物与生理生化数据 (Metabolomics & Physiology)：
产物分析：包含 beta-丙氨酸产量定量数据及有机酸副产物积累情况。
氧化应激指标：提供了超氧阴离子和过氧化氢的定量检测数据，反映菌株胞内的氧化应激水平。
硫化氢 测定：记录了添加 NaHS 后胞内 硫化氢的含量变化，可能涉及气体信号分子对代谢或抗逆性的调控研究。
数据来源与方法：
组学数据基于高通量测序（Illumina/Nanopore）与质谱技术（LC-MS/MS）获得；生理生化指标（ROS、H2S 等）及代谢产物通过酶标仪比色法、高效液相色谱 (HPLC) 等方法测定。