Mayaro Virus as the cause of Acute Febril Illness in the Colombian Amazon Basin

El sindrome febril agudo indiferenciado se define como un incremento subito de la temperatura, acompanado de otros sintomas causados por una amplia variedad de patogenos. La fiebre tiene multiples etiologias, en donde se incluyen para el caso de Suramerica las infecciones por el parasito protozoario Plasmodium falciparum, causante de la malaria; infeccion causada por el virus del dengue, Leptospira spp., Rickettsia spp. fiebre tifoidea, chikungunya y el zika, asi como otra gran diversidad de parasitos, virus y bacterias. Por esta razon es comun que las personas acudan a los servicios de atencion medica.Teniendo en cuenta la amplia gama de patogenos que pueden ser responsables de la enfermedad febril, es un reto detectar la etiologia de esta, unicamente con unas pocas pruebas de diagnostico, lo que aumenta el riesgo de que la enfermedad progrese hasta convertirse en una enfermedad potencialmente moral por la ausencia de un tratamiento adecuado.Sin embargo, los avances en la secuenciacion del genoma, como la secuenciacion metagenomica de proxima generacion, se presenta como una herramienta prometedora para afrontar el desafio de identificar etiologias de fiebre, al permitir la deteccion imparcial de agentes infecciosos en una muestra biologica. Cabe resaltar que la deteccion de estos patogenos puede ayudar al diseno de diagnosticos dirigidas y a mejorar la vigilancia epidemiologica de los paises de bajos y medianos ingresos como en el caso de Colombia.El enfoque metagenomico ha llevado al exito en la deteccion de patogenos, para los cuales los metodos tradiciones de deteccion fallan. Con este objetivo se pretende realizar una caracterizacion con enfoque metagenomico de potenciales patogenos asociados al sindrome febril indiferenciado en diferentes municipios de Colombia