VatsalPatel18/head-and-neck-cancer-expression-data
收藏Hugging Face2024-07-03 更新2024-07-06 收录
下载链接：
https://hf-mirror.com/datasets/VatsalPatel18/head-and-neck-cancer-expression-data
下载链接
链接失效反馈官方服务：
资源简介：
该数据集包含来自TCGA和CPTAC数据集的头颈癌样本的基因表达数据。数据已经过分位数归一化和使用ComBat进行批次效应校正。数据集包含两个主要文件：`combat_corrected_expression_data.csv`（批次效应校正后的表达数据）和`normalized_expression_data.csv`（归一化后的表达数据）。
This dataset contains gene expression data for head and neck cancer samples from the TCGA and CPTAC datasets. The data has been quantile normalized and batch effect corrected using ComBat. Main files include batch effect corrected expression data and normalized expression data.
提供机构：
VatsalPatel18
原始信息汇总
头颈癌表达数据集
概述
该数据集包含来自TCGA和CPTAC数据集的头颈癌样本的基因表达数据。数据已经过分位数归一化和批次效应校正（使用ComBat）。
文件
combat_corrected_expression_data.csv: 批次效应校正后的表达数据。normalized_expression_data.csv: 分位数归一化后的表达数据。
使用方法
python from datasets import load_dataset
dataset = load_dataset("VatsalPatel18/head-and-neck-expression-data") combat_corrected = dataset["combat_corrected_expression_data.csv"] normalized_data = dataset["normalized_expression_data.csv"]
