UbiBrowser

UbiBrowser 2.0 is a comprehensive resource for proteome-wide known and predicted ubiquitin ligase E3/deubiquitinase DUB - substrate interactions in eukaryotic species. These E3/DUB-substrate interactions are derived from five data sources: manual curation, protein GO annotation, protein domain, protein motif and network topology.

泛素浏览器2.0（UbiBrowser 2.0）是一款覆盖真核生物物种的综合性资源库，收录了全蛋白质组范围内已知及预测得到的泛素连接酶E3（ubiquitin ligase E3）/去泛素化酶DUB（deubiquitinase DUB）与其底物的相互作用数据。

此类E3/DUB-底物相互作用数据源自五类数据源：人工整理注释、蛋白质基因本体（Gene Ontology）注释、蛋白质结构域（protein domain）、蛋白质基序（protein motif）以及网络拓扑结构（network topology）。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

UbiBrowser 2.0是一个综合性数据库，专注于真核生物中泛素连接酶（E3）和去泛素化酶（DUB）与底物之间的已知和预测相互作用，覆盖39个物种。数据来源于手动整理、蛋白质GO注释、结构域、基序和网络拓扑等多个证据，并通过计算框架生成置信度评分，提供用户友好的搜索功能以支持蛋白质相互作用查询。