青藏高原冰川冰雪微生物扩增子测序数据集（V1.0）（2016-2020）

该数据集包含2016年11月至2020年8月在青藏高原采集的15条冰川共269个冰雪样品微生物扩增子测序数据，包括24K冰川（24K）、冬克玛底冰川（DKMD）、敦德冰川（DD）、杰玛央宗冰川（JMYZ）、廓琼岗日冰川（KQGR）、来古冰川（LG）、帕隆4号冰川（PL4）、羌塘1号冰川（QT）、枪勇冰川（QY）、曲玛冰川（QM）、唐古拉龙匣宰陇巴冰川（TGL）、夏岗江冰川（XGJ）、雅拉冰川（YA）、泽普沟冰川（ZPG）、珠峰东绒布冰川（ZF）。采样区域经纬度范围为28.020°N到38.100°N和86.28°E到95.651°E。
通过聚合酶链式反应（PCR），采用515F/907R（或515F/806R）引物对16s rRNA基因的V4-V5区（或V4区）片段进行扩增，并用Illumina Hiseq2500测序平台测序获得原始数据。所选引物序列分别为：“515F_GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; 907R_CCGTCAATTCMTTTRAGTTT”“515F_GTGCCAGCMGCCGCGG, 806R_GGACTACHVGGGTWTCTAAT”。上传的数据包括：样品编号，样品描述，采样时间，经纬度坐标，样品类型，测序目标，测序片段，测序引物，测序平台，数据格式等基础信息，测序数据以序列文件数据格式正向 *.1.fq.gz和反向 *.2.fq.gz压缩文件储存。

This dataset contains microbial amplicon sequencing data for 269 snow/ice samples collected from 15 glaciers on the Qinghai-Tibet Plateau between November 2016 and August 2020. The 15 glaciers are: 24K Glacier (24K), Dongkemadi Glacier (DKMD), Dunde Glacier (DD), Jiemayangzong Glacier (JMYZ), Kuoqionggangri Glacier (KQGR), Laigu Glacier (LG), Palong No.4 Glacier (PL4), Qiangtang No.1 Glacier (QT), Qiangyong Glacier (QY), Quma Glacier (QM), Tanggula Longxia Zailongba Glacier (TGL), Xiagangjiang Glacier (XGJ), Yala Glacier (YA), Zepugou Glacier (ZPG), and East Rongbuk Glacier on Mount Qomolangma (ZF). The sampling area spans latitudes from 28.020°N to 38.100°N and longitudes from 86.28°E to 95.651°E.

The V4-V5 (or V4) hypervariable regions of the 16S rRNA gene were amplified using primer pairs 515F/907R (or 515F/806R) via Polymerase Chain Reaction (PCR), and raw sequencing data were generated on the Illumina HiSeq 2500 platform. The sequences of the selected primers are: 515F_GTGCCAGCMGCCGCGGTAA; 907R_CCGTCAATTCMTTTRAGTTT and 515F_GTGCCAGCMGCCGCGG, 806R_GGACTACHVGGGTWTCTAAT.

The uploaded dataset includes basic metadata such as sample ID, sample description, sampling time, geographic coordinates, sample type, sequencing target, sequenced fragment, sequencing primers, sequencing platform, and data format. The sequencing data are stored as compressed paired-end sequence files with the naming formats of forward reads *.1.fq.gz and reverse reads *.2.fq.gz.

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集是2016年至2020年间在青藏高原15条冰川采集的269个冰雪样品的微生物扩增子测序数据，覆盖广泛的地理范围（28.020°N-38.100°N, 86.28°E-95.651°E）。数据通过针对16s rRNA基因V4-V5区或V4区的PCR扩增和Illumina Hiseq2500测序获得，以fastq格式存储，总大小为2.20 GB，适用于研究高海拔冰川环境中的微生物多样性。