CoxPathDB

CoxPathDB for Tomato aims to enable users to identify pathways that are functionally relevant to a query gene of interest in tomato (Solanum lycopersicum). In order to achieve this, it provides, for the query gene, a ranked list of KEGG pathways, where the higher ranked pathways are more likely related to the query gene.面向番茄的CoxPathDB数据库旨在助力用户鉴定与目标查询基因在番茄（Solanum lycopersicum）中具有功能相关性的通路。为实现这一目标，该数据库可为查询基因提供一份排序后的KEGG通路列表，其中排序位次越高的通路，与该查询基因的相关性越强。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CoxPathDB for Tomato是一个旨在预测番茄中查询基因相关KEGG通路的数据库，通过提供排名通路列表来实现。该服务已由Kazusa DNA Research Institute于2024年1月底终止，相关引用信息包括研究论文和访问链接。