Séquences des communautés procaryotes des mésocosmes et microcosmes du lac Croche (Saint-Hoppolyte) exposés à un gradient de salinité (0.01 - 3.22 ppt de chlorure de sodium), du 23/06/2018 au 03/08/2018, et du 27/05/2019 au 08/07/2019

Plusieurs mésocosmes ont été établis au sein du lac Croche (23/06/2018), à Saint-Hippolyte, Qc, Ca. Ceux-ci comportaient un gradient de salinité variant de 0.01 à 3.22 ppt de chlorure de sodium (NaCl), afin d'observer l'effet de différentes concentration en NaCl sur les communautés microbiennes (bactéries, archées). Des échantillons de 1L d'eau de l'épilimnion des différents mésocosmes ont été collectés après 3 semaines (13/07/2108) et après 6 semaines d'incubation (03/08/2018). Plusieurs volumes d'eau et de sédiments de l'hypolimnion du lac croche ont également été collectés (27/05/2019) afin d'établir des microcosmes à salinité similaires, depuis lequels 100 mL d'eau et 10g de chaque microcosmes ont été extrait après 3 semaines (17/06/2019) et 6 semaines (08/07/2019). Les échantillons ainsi obtenus ont subi un séquençage illumina (MiSeq) des gènes ARNr 16S bactériens et archés, ainsi que 18S eucaryotes. L'ensemble des UTO obtenus ont été analysés afin de mieux comprendre l'implication du syndrome de salinisation des eaux douces sur les communautés microbiennes.