Omnitrophota marker gene trees
收藏figshare.com2022-08-14 更新2025-03-27 收录
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Phylogenetic trees associated with Omnitrophota marker genes. All trees are newick format.
rooted-16-tree.nwk : Rooted 16S rRNA gene tree.
bac120-alignment-hmq-trimal.faa.treefile: Bac120 marker alignment of high and medium quality species cluster representatives.
bcg110-alignment-hmq-trimal.faa.treefile: "Bacterial core genome" bcg110 marker alignment of high and medium quality species cluster representatives.
ubcg-alignment-hmq-trimal.faa.treefile: "Up-to-date bacterial core genome" ubcg marker alignment of high and medium quality species cluster representatives.
uni56-alignment-hmq-trimal.faa.treefile: "universal" 56 marker alignment of high and medium quality species cluster representatives.
与Omnitrophota标记基因相关的系统发育树。所有树均采用Newick格式。
rooted-16-tree.nwk：16S rRNA基因的根树。
bac120-alignment-hmq-trimal.faa.treefile：高质量和中质量物种簇代表序列的Bac120标记对齐。
bcg110-alignment-hmq-trimal.faa.treefile：细菌核心基因组bcg110标记的高质量和中质量物种簇代表序列对齐。
ubcg-alignment-hmq-trimal.faa.treefile：最新版细菌核心基因组ubcg标记的高质量和中质量物种簇代表序列对齐。
uni56-alignment-hmq-trimal.faa.treefile：通用56标记的高质量和中质量物种簇代表序列对齐。
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