Annotation information of Quercus mongolica genome
收藏DataCite Commons2020-07-31 更新2024-07-28 收录
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在这项研究中，基于Illumina HiSeq X Ten，PacBio Sequel II平台和高通量染色体构象捕获（Hi-C）技术的组合策略对整个基因组进行了测序，并且首次报道了染色体水平装配。其基因组测序的原始草图长度为809.84Mb，重叠群N50大小的初始装配为2.64Mb。Hi-C辅助基因组组装后，由蒙古木Q基因组序列和方向决定的染色体长度为774.59Mb，锚定在12条染色体上，重叠群N50大小为2.51Mb，支架N50大小为66.74Mb，重叠群长度锚定率为95.65％，重叠群数量锚定率为57.18％。此外，其基因组包含532.67 Mb转座因子（TEs），占装配体的65.64％。我们注释了36 553个蛋白质编码基因（其中94.89％完成了功能注释）和11,431个非蛋白质编码基因。该染色体水平的基因组将极大地促进栎的进一步生物学研究，以及蒙古Q种质资源的开发和商业利用。<br>
提供机构：
figshare
创建时间：
2020-02-23
