CONGOLOBE_NGS

Caractérisation des communautés bactériennes et archéennes présentes dans des sédiments marins profonds à l’échelle du vaste complexe des lobes distaux du Congo. Les échantillons ont été collectés par des opérations de surface à l’aide du carottier Calypso pour les sites A, B F et C. La diversité microbienne a été appréhendée par séquençage haut-débit Illumina HiSeq des gènes codants pour la petite sous-unité 16S du ribosome.
Dans un second temps, une comparaison des communautés microbiennes inter-sites a été réalisée. Cette comparaison porte sur la structure et l’identité taxonomique des communautés microbiennes et l’identification des paramètres environnementaux contrôlant la structure des communautés microbiennes des lobes profonds de l’éventail turbiditique du Congo.