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scPLAD is a single-cell-based plant lncRNA atlas database that provides information on the expression and gene regulatory networks of lncRNAs in Arabidopsis. It showcases the cell-type-specific expression patterns of lncRNAs and reveals the roles of putative transcription factors in regulating these expressions.

scPLAD是一款基于单细胞技术的植物长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)图谱数据库,可提供拟南芥中长链非编码RNA的表达情况及其基因调控网络相关信息。该数据库展示了长链非编码RNA的细胞类型特异性表达模式,并揭示了推定转录因子在调控此类表达过程中所发挥的作用。

提供机构:
南京大学
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数据集介绍
scPLAD 数据集图片
背景与挑战
背景概述
scPLAD是一个基于单细胞转录组数据的植物lncRNA图谱数据库,专注于拟南芥,整合了28个已发表数据集中的24848个lncRNA信息。该数据库揭示了lncRNA的细胞类型特异性表达模式及其调控网络,并提供细胞图谱、标记基因分析和通路富集等功能模块。
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