hg38 and mm10 1kb GC and mappability files
收藏Mendeley Data2024-01-31 更新2024-06-26 收录
下载链接：
https://data.mendeley.com/datasets/jr36ntmzsh
下载链接
链接失效反馈官方服务：
资源简介：
hg38 and mm10 GC and mappability files, suitable for use in linCNV and other genomics pipelines. Files *.gc5Base.bin_1000.bed.gz are the average fractional GC content, files *.kmer_50.bin_1000.bed.gz are the average fractional mappability using a kmer size of 50. $ zcat hg38.gc5Base.bin_1000.bed.gz | head -n4 chr1 10000 11000 200 0.646 . chr1 11000 12000 200 0.543 . chr1 12000 13000 200 0.6 . chr1 13000 14000 200 0.575 . $ zcat hg38.kmer_50.bin_1000.bed.gz | head -n4 chr1 10000 11000 . 0.155 . chr1 11000 12000 . 0.105 . chr1 13000 14000 . 0.056 . chr1 14000 15000 . 0.05 .
创建时间：
2024-01-31
搜集汇总
背景与挑战
背景概述
该数据集提供hg38和mm10基因组的GC含量和可映射性文件，以1kb为分辨率，适用于linCNV等基因组学分析流程。文件包括平均GC含量和基于kmer大小为50的平均可映射性数据，以BED格式存储，便于基因组区域计算和整合。
以上内容由遇见数据集搜集并总结生成
