CTPAD

CTPAD is an interactive R Shiny web tool that integrates and standardizes public allergic disease transcriptomic data (human/mouse) from GEO. It enables comprehensive analysis and visualization, including gene expression profiling, pathway enrichment, immune cell infiltration estimation, correlation, and single-cell RNA-seq analysis, specifically designed to facilitate research into allergic disease mechanisms without requiring bioinformatics expertise.CTPAD是一款交互式R Shiny网页工具，可整合并标准化来自GEO（Gene Expression Omnibus，基因表达综合数据库）的公开过敏性疾病转录组学数据（涵盖人类与小鼠样本）。该工具支持多维度综合分析与可视化功能，具体包括基因表达谱分析、通路富集分析、免疫细胞浸润水平评估、相关性分析以及单细胞RNA测序（single-cell RNA-seq）数据分析；其专为无需生物信息学专业背景的研究者设计，旨在推动过敏性疾病致病机制相关研究工作。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CTPAD是一个交互式R Shiny网络工具，用于整合和标准化来自GEO的公共过敏性疾病转录组数据（涵盖人类和鼠类），支持基因表达分析、通路富集、免疫细胞浸润估计等多种分析功能。该工具专为过敏性疾病机制研究设计，无需生物信息学专业知识即可使用，便于研究人员进行数据可视化和深入分析。