Evolutionary optimization of computationally designed enzymes: Kemp eliminases of the KE07 series

NIAID Data Ecosystem2026-05-01 收录

计算酶设计

定向进化

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资源简介：

Evolutionary optimization of computationally designed enzymes: Kemp eliminases of the KE07 series

创建时间：

2024-04-03

催化元件库的序列数据

定向进化

合成生物学

催化元件库数据集包含了酶催化元件定向挖掘和酶催化元件多目标协同进化数据。通过在土壤中对腈水解酶、腈水合酶等多种酶进行挖掘，将有活性的酶进行基因测序并克隆到表达载体上；通过在数据库对包含腈水解酶、烯烃还原酶、醛酮还原酶、羰基还原酶等在内的多种酶进行筛选，委托生物公司合成酶基因序列，克隆到表达载体上；通过设计的引物对醛酮还原酶、羰基还原酶等在内的多种酶进行定点突变，构建出催化性能增强的酶序列。数据采集

国家基础学科公共科学数据中心130

Discovery, Design, and Structural Characterization of Alkane-Producing Enzymes across the Ferritin-like Superfamily

产烷烃酶发现与设计

计算酶设计

To complement established rational and evolutionary protein design approaches, significant efforts are being made to utilize computational modeling and the diversity of naturally occurring protein seq

NIAID Data Ecosystem60

Thymidine kinase mutants obtained by random sequence selection.

定向进化

抗病毒药物代谢酶工程

Knowledge of the catalytic properties and structural information regarding the amino acid residues that comprise the active site of an enzyme allows one, in principle, to use site-specific mutagenesis

PubMed Central1993-05-01 更新40

SeprotHub/Dataset-GB1-fitness

蛋白质适应性预测

定向进化

本数据集包含了突变GB1蛋白质的健身分数。蛋白质数据以AA序列的格式存在。数据集被划分为训练集、验证集和测试集，分别包含119644、14917和14800个样本。标签为突变蛋白质的健身分数，是相对于野生型的相对健身值，所有分数大于0，分数大于1表示相对于野生型具有更高的健身。

Hugging Face2025-05-09 更新130

Directed evolutionary changes in Kemp Eliminase KE07 - Crystal 7 Round 5

蛋白质工程

定向进化

Directed evolutionary changes in Kemp Eliminase KE07 - Crystal 7 Round 5

NIAID Data Ecosystem50