BL-Hi-C在13个K562细胞系样本上的应用
收藏国家基础学科公共科学数据中心2024-03-05 收录
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资源简介:
这项研究工作通过生物信息学分析和分子生物学实验,筛选出能够靠近染色质三维结构相关蛋白的DNA结合位点的限制性内切酶HaeIII。使用HaeIII在细胞核内切割基因组DNA,之后配合两步连接法完成空间邻近片段的连接、文库构建与测序,建立了一种不依赖抗体和探针捕获的染色质三维空间结构捕获富集策略BL-Hi-C。
研究者使用BL-Hi-C展示了K562细胞β-globin区域在1 kb分辨率下的三维基因组精细调控结构。总数据量为158.8GB
提供机构:
清华大学



