CAPS-DB : a structural classification of helix-capping motifs

CAPS-DB is a structural classification of helix-cappings or caps compiled from protein structures. Caps extracted from protein structures have been structurally classified based on geometry and conformation and organized in a tree-like hierarchical classification where the different levels correspond to different properties of the caps.

CAPS-DB 是一套汇编自蛋白质结构的螺旋帽化（helix-capping）结构或帽结构的结构分类体系。从蛋白质结构中提取的帽结构，已依据几何特征与构象完成结构分类，并被组织为类树状层级分类体系，该体系的不同层级分别对应帽结构的不同属性。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CAPS-DB是一个基于蛋白质结构编译的螺旋帽结构分类数据库，它根据几何和构象特征对螺旋帽进行结构分类，并采用树状层次结构组织。该数据库可浏览、可搜索，并定期更新，包含7390个PDB结构、1627个簇和67530个帽的统计信息。