RGAP

RGAP includes 16 whole genome rice assemblies and sequence variants generated from multiple rice pan-genome projects including the 3000 Rice Genomes Project. We updated gene expression abundance data with 80 RNA-sequencing datasets and to facilitate gene function discovery, performed gene coexpression resulting in 39 coexpression modules that capture highly connected sets of co-regulated genes.RGAP数据集包含16套水稻全基因组组装序列，以及来自多项水稻泛基因组项目（包括3000份水稻基因组计划）所产生的序列变异信息。本数据集的基因表达丰度数据基于80套RNA测序（RNA-sequencing）数据集完成更新；为助力基因功能发掘，研究团队开展了基因共表达分析，最终构建得到39个共表达模块，这些模块可捕获共调控基因的高度关联集合。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

RGAP数据集整合了来自多个水稻泛基因组项目的16个全基因组水稻组装和序列变异。它更新了80个RNA测序数据集的基因表达丰度数据，并提供了39个共表达模块，以支持基因功能的研究。