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Hoxd3 chromatin is activated

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reactome.org2025-03-23 收录
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Retinoic acid induces expression of Hoxd3 in embryos (Folberg et al. 1999) and fetal cortical neurons (Chai et al. 2009), but it is unknown if the effect is direct or indirect. The retinoid receptor Rarb is not responsible for the inducibility in embryos (Folberg et al. 1999). Hoxd3 is expressed in rhombomeres 5,6, and 7 (r5-7) (Tan et al. 1996, Gaufo et al. 2003) and in more caudal regions: the spinal cord, dorsal root ganglia, first cervical vertebrae, thyroid gland, kidney tublules, esophagus, stomach, and intestines (Tan et al. 1996).<br>In mouse embryonic stem cells treated with retinoic acid Hoxd3 chromatin is activated by loss of methylation at lysine-27 of histone H3 (H3K27me3) and loss of Polycomb repressive complex 2 (PRC2) (Williamson et al. 2012, Mazzoni et al. 2013). In human fibroblasts, the histone demethylase KDM6A participates in removing H3K27me3. The Mll2 complex methylates H3K4 at Hoxd3 in fibroblasts (Wang et al. 2009).

维甲酸可诱导胚胎(Folberg 等人,1999年)及胎儿皮质神经元(Chai 等人,2009年)中 Hoxd3 的表达,然而其作用机制尚不明确,是直接作用抑或间接作用尚待探究。维甲酸受体 Rarb 并非胚胎中诱导表达的直接因素(Folberg 等人,1999年)。Hoxd3 在菱形区 5、6 和 7(r5-7)(Tan 等人,1996年,Gaufo 等人,2003年)以及更尾侧的区域中表达,包括脊髓、背根神经节、第一颈椎、甲状腺、肾小管、食管、胃和肠道(Tan 等人,1996年)。在经维甲酸处理的鼠胚胎干细胞中,Hoxd3 的染色质通过组蛋白 H3 赖氨酸-27(H3K27me3)的去甲基化和 Polycomb 抑制复合体 2(PRC2)的丢失而被激活(Williamson 等人,2012年,Mazzoni 等人,2013年)。在人类成纤维细胞中,组蛋白去甲基化酶 KDM6A 参与去除 H3K27me3。Mll2 复合物在成纤维细胞中甲基化 Hoxd3 的 H3K4 位点(Wang 等人,2009年)。
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