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柠檬酸合酶和OGDH作为动脉粥样硬化在应激下的可能生物标志物

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国家青藏高原科学数据中心2023-09-20 更新2024-03-06 收录
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https://data.tpdc.ac.cn/zh-hans/data/5b9b6d52-d737-4815-9393-57b6689ff3bc
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资源简介:
本数据集包括目的蛋白的含量、基因的表达量以及柠檬酸合酶和OGDH的酶活性以及免疫共沉淀(IP)测定和分子之间的相互作用,源于新西兰大白兔构建CS和AS动物模型的蛋白质组学和生物信息学获得的蛋白。对不同组间基因的分布、差异表达基因以及主要富集通路均采用R.studio软件,采用limma包、WGCNA包、ggplot2等进行数据分析,在肾上腺中鉴定了与CS和AS相关的两种最重要的枢纽蛋白(柠檬酸盐合酶和OGDH)。枢纽蛋白主要富集于线粒体质子转运ATP合酶复合物、ATP酶活化和AMPK信号通路。与对照组相比,AS+CS组肾上腺更大,更紊乱、不规则、坏死。在蛋白质和mRNA水平上,AS+CS组柠檬酸盐合酶和OGDH的表达均高于对照组(P < 0.05)。通过Spearman的rho分析、受试者工作特征曲线、神经网络模型和三次样条插值,肾上腺、柠檬酸盐合酶和OGDH的横截面积之间存在很强的相关性(P < 0.05)。在动脉粥样硬化和慢性应激下,柠檬酸盐合酶和OGDH的酶活性增加。通过CCK8测定,在柠檬酸盐合酶和OGDH的敲低实验后,肾上腺细胞活力显着下调。靶基因-TF-miRNA调控网络揭示了预测的microRNA、柠檬酸合酶和OGDH之间的密切相互关系。免疫共沉淀(IP)测定后,结果表明柠檬酸盐合酶和OGDH在肾上腺共表达。分子对接研究表明,柠檬酸合酶与OGDH最佳复合构象的对接得分为-6.15 kcal/mol。
提供机构:
刘德平
创建时间:
2023-09-19
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