马里亚纳海沟厌氧细菌PB63新种鉴定数据集
收藏国家海洋科学数据中心2025-08-30 更新2024-04-21 收录
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http://msdc.qdio.ac.cn/data/metadata-special-detail?id=1769927544418684929&otherId=1769927544573874178
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在这项研究中,我们报道了从马里亚纳海沟的深海沉积物中分离出来的一种革兰氏阴性、橙色、杆状的厌氧细菌,命名为菌株PB63,PB63的生长发生在10-35摄氏度(最适28摄氏度)、pH 5.0-8.0(最适5.0-6.0)和0-7%(w/v)NaCl(最适2-3%)下。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析结果表明,PB63为新鞘脂菌属成员,与Novosphingopyxis baekryungensis DSM 16222(T)亲缘关系密切(序列相似性为97.9%)。PB63对多种重金属表现出耐受性,包括Co2+、Zn2+、Mn2+和Cu2+。PB63的全基因组中包含许多与重金属抗性有关的基因。PB63的基因组DNA G+C含量为62.8mol%。PB63的主要呼吸醌是泛醌-10(Q-10)。PB63(T)的极性脂质含有二磷脂酰甘油、磷脂酰甘油,磷脂酰乙醇胺、鞘磷脂、糖脂、磷脂酰胆碱和三种未鉴定的脂质。PB63的主要脂肪酸包括总summed feature 8 (C18:1 ω7c or/and C18:1 ω6c), C14:0 2-OH, 11-methyl C18:1 ω7c, C16:0, summed feature 3 (C16:1 ω7c and/or C16:1 ω6c) and C17:1 ω6c。系统发育、生理、生化和形态学分析结果表明,菌株PB63(T)是新鞘氨醇粘菌属的一个新种,命名为Novosphingopyxis iocasae sp. nov。



