Oryza coarctata Genome

The draft genome assembly has 573 Mb comprised of 8877 scaffolds with N50 length of 205 kb. A total of 50,562 protein-coding genes are predicted, of which a significant fraction was found to be involved in secondary metabolite biosynthesis and hormone signal transduction pathways.该草图基因组组装（draft genome assembly）总规模为573 Mb，由8877条支架序列（scaffolds）构成，其N50长度为205 kb。本研究共预测得到50562个蛋白质编码基因，其中相当比例的基因参与次生代谢产物生物合成与激素信号转导通路。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集提供了野生盐生水稻Oryza coarctata的基因组草稿序列和注释，包括支架级别的组装、基因表达数据、非编码RNA信息以及DNA甲基化图谱。这些资源旨在支持功能基因组学研究，并有助于工程化水稻的耐盐和耐淹胁迫性状。