maomlab/B3DB|药物化学数据集|生物医学数据集

血脑屏障数据库（B3DB）是一个经过整理的数据库，包含了50个已发表资源中关于血脑屏障穿透的分类和数值测量数据。该数据集适用于表格分类和回归任务，涵盖了与化合物化学和生物学特性相关的各种配置和特征。

原始信息汇总

Blood-Brain Barrier Database (B3DB)

数据集概述

B3DB 是一个从 50 个已发表资源中整理的关于血脑屏障渗透性的分类和数值测量数据集。

任务类别

• 表格分类
• 表格回归

标签

• 化学
• 生物学
• 医学

数据集名称

Blood-Brain Barrier Database (B3DB)

数据集摘要

整理了 50 个已发表资源的血脑屏障渗透性的分类和数值测量数据。

引用

@article{ Meng_A_curated_diverse_2021, author = {Meng, Fanwang and Xi, Yang and Huang, Jinfeng and Ayers, Paul W.}, doi = {10.1038/s41597-021-01069-5}, journal = {Scientific Data}, number = {289}, title = {A curated diverse molecular database of blood-brain barrier permeability with chemical descriptors}, volume = {8}, year = {2021}, url = {https://www.nature.com/articles/s41597-021-01069-5}, publisher = {Springer Nature} }

数据集大小

• 1K<n<10K

配置名称

• B3DB_classification
• B3DB_classification_extended
• B3DB_regression
• B3DB_regression_extended

配置详情

B3DB_classification

• 特征:
  • NO. (int64)
  • compound_name (string)
  • IUPAC_name (string)
  • SMILES (string)
  • CID (float64)
  • logBB (float64)
  • BBB+/BBB- (class_label)
  • Inchi (string)
  • threshold (float64)
  • reference (string)
  • group (string)
  • comments (string)
  • ClusterNo (int64)
  • MolCount (int64)
• 分割:
  • train: 5856 个样本, 656000 字节
  • test: 1951 个样本, 218640 字节

B3DB_classification_extended

• 分割:
  • train: 5856 个样本, 76221824 字节
  • test: 1951 个样本, 25394344 字节

B3DB_regression

• 特征:
  • NO. (int64)
  • compound_name (string)
  • IUPAC_name (string)
  • SMILES (string)
  • CID (string)
  • logBB (float64)
  • Inchi (string)
  • reference (string)
  • smiles_result (string)
  • group (string)
  • comments (float64)
  • ClusterNo (int64)
  • MolCount (int64)
• 分割:
  • train: 795 个样本, 82808 字节
  • test: 263 个样本, 27480 字节

B3DB_regression_extended

• 分割:
  • train: 795 个样本, 10347848 字节
  • test: 263 个样本, 3423336 字节