GenomeMUSter

GenomeMUSter is a comprehensive SNP data resource that includes typed, sequenced, and imputed genotypes of 657 inbred mouse strains and their derivatives across chromosomes 1-19, X, Y, and Mt. Genotypes from ten legacy datasets available from MPD, the Sanger REL2004 and REL1505, whole genome sequencing of the Collaborative Cross (CC), BXD recombinant inbred strains and C57BL/6J Eve (B6Eve), and long read whole genome sequencing of 42 inbred strains were merged by chromosome and within chromosome in 10 Mb segmented regions.GenomeMUSter是一款综合性单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism, SNP）数据资源，涵盖657个近交小鼠品系及其衍生株系在1至19号染色体、X染色体、Y染色体以及线粒体（Mt）基因组上的分型基因型、测序基因型与推算基因型。针对来自十个传统数据集的基因型数据，研究人员按染色体及染色体内10 Mb分段区域完成了整合；这些数据集包括小鼠表型组数据库（Mouse Phenome Database, MPD）中的数据、Sanger研究所的REL2004与REL1505数据集、协作杂交（Collaborative Cross, CC）群体的全基因组测序数据、BXD重组近交系的全基因组测序数据、C57BL/6J Eve（B6Eve）的全基因组测序数据，以及42个近交小鼠品系的长读长全基因组测序数据。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

GenomeMUSter是一个全面的SNP数据资源，整合了657个近交系小鼠品系及其衍生物在染色体1-19、X、Y和Mt上的基因型数据，涵盖分型、测序和插补基因型。该资源合并了来自MPD、Sanger REL2004/REL1505、协作交叉（CC）全基因组测序、BXD重组近交系品系、C57BL/6J Eve以及42个近交系品系的长读长全基因组测序等十个历史数据集。