AmelieSchreiber/family_split_protein_binding_sites
收藏Hugging Face2023-09-07 更新2024-03-04 收录
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资源简介:
这是一个包含209,571个来自UniProt的蛋白质序列的训练/测试划分数据集,这些序列带有活性位点和结合位点的标签。所有蛋白质序列(以及相应的结合位点标签)被分割成1000或更少的部分,分割后的序列在Entry列标签中通过`_partN`后缀表示。数据集在分割前按照85/15的比例进行训练/测试划分,蛋白质按家族降序排列,序列较多的家族排在前面。此外,训练/测试划分确保家族之间没有重叠,测试数据集由最大的家族组成。
提供机构:
AmelieSchreiber
原始信息汇总
UniProt Segmented Binding/Active Sites
概述
- 任务类别: 词性标注
- 语言: 英语
- 标签: 蛋白质
- 数据集名称: UniProt Segmented Binding/Active Sites
- 数据集大小: 100K<n<1M
详细描述
- 数据来源: UniProt
- 序列数量: 209,571个蛋白质序列
- 标签类型: 活性位点和结合位点标签
- 序列分割: 所有蛋白质序列及其相应的结合位点标签被分割成不超过1000个碱基的片段,片段在Entry列标签中通过
_partN后缀表示 - 数据分割: 训练集和测试集的比例约为85/15,分割前进行
- 排序方式: 蛋白质按家族降序排列,序列较多的家族排在前面
- 测试集选择: 测试集包含最大的家族,且训练集和测试集的家族不重叠



