kamaludeen/fututech-colorectal-cancer

该数据集包含156个通过宏基因组测序获得的粪便样本，这些样本来自结直肠腺瘤和癌患者以及健康对照组。数据集用于研究肠道微生物群在结直肠癌发生中的作用，并揭示了与疾病相关的微生物基因、菌株和功能。数据集配置包括presence-absence和CLR两种形式。

原始信息汇总

数据集概述

任务类别

• 表格分类

标签

• 微生物组
• 表格数据
• 肠道微生物

数据集名称

• Colorectal Carcinoma Feng Q 2015

数据规模

• 样本数量小于1000

数据集描述

• 包含156个来自结直肠腺瘤和癌患者以及健康对照组的粪便样本的宏基因组鸟枪测序数据。

配置

• presence-absence
• CLR

使用示例

python dataset = load_dataset("wwydmanski/colorectal-carcinoma-microbiome-fengq", "presence-absence") train_dataset, test_dataset = dataset[train], dataset[test] X_train = np.array(train_dataset[values]) y_train = np.array(train_dataset[target])

X_test = np.array(test_dataset[values]) y_test = np.array(test_dataset[target])