LnCeCell

LnCeCell 2.0 is an updated resource for lncRNA-associated ceRNA networks, integrating 257 stRNA-seq datasets across 86 diseases and 80 normal tissues. It provides 836,581 cell/spot-specific ceRNA interactions, 15,489 curated lncRNA biomarkers, clinical profiles of 20,326 cancer patients, and 24 analytical tools for exploring ceRNA mechanisms at single-cell/spatial resolution.LnCeCell 2.0 是一款面向长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）相关内源竞争RNA（competing endogenous RNA，ceRNA）调控网络的更新型数据库资源，整合了覆盖86种疾病与80种正常组织的257套空间转录组测序（spatial transcriptome sequencing，stRNA-seq）数据集。该资源共提供836,581个细胞/位点特异性的ceRNA互作关系、15,489条经人工注释筛选的lncRNA生物标志物、20,326名癌症患者的临床特征档案，以及24款可用于解析单细胞/空间分辨率下ceRNA调控机制的分析工具。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

LnCeCell 2.0是一个更新版的lncRNA相关ceRNA网络资源，整合了257个单细胞和空间转录组数据集，涵盖86种疾病和80个正常组织。它提供了超过83万个细胞/位点特异性ceRNA相互作用、近1.5万个经人工整理的lncRNA生物标志物、2万多名癌症患者的临床资料，以及24个分析工具，用于在单细胞和空间分辨率下探索ceRNA调控机制。