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Agrilus planipennis genome annotations v0.5.3

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agdatacommons.nal.usda.gov2023-12-14 更新2025-03-22 收录
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https://agdatacommons.nal.usda.gov/articles/dataset/Agrilus_planipennis_genome_annotations_v0_5_3/24662091/1
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资源简介:
This dataset presents the Agrilus planipennis gene set BCM_v_0.5.3. RNA-Seq data was used with additional protein homology data for a MAKER automated annotation of the Agrilus planipennis genome assembly 1.0. This dataset is free for all use. Resources in this dataset:Resource Title: Agrilus planipennis genome annotations v0.5.3. File Name: agrpla_BCM_version_0.5.3.tar.gzResource Description: The attached tar.gz archive (APLA_BCM_version_0.5.3.tar.gz) contains the following files: APLA.CDS.fna. CDS sequences of the genome annotations v0.5.3. APLA.faa. Amino acid sequences of the genome annotations v0.5.3. APLA.fna. cDNA sequences of the genome annotations v0.5.3. APLA.Models.gff3. Gff3 of all gene predictions of the genome annotations v0.5.3. APLA.Analysis.gff3 Gff3 of all evidence contributing to the genome annotations v0.5.3.

本数据集展示了 Agrilus planipennis 基因组集合 BCM_v_0.5.3 的 RNA-Seq 数据,并辅以额外的蛋白质同源性数据,通过 MAKER 自动注释工具对 Agrilus planipennis 基因组组装 1.0 进行了注释。本数据集对所有使用者免费开放。数据集中包含以下资源: 资源标题:Agrilus planipennis 基因组注释 v0.5.3。 文件名:agrpla_BCM_version_0.5.3.tar.gz 资源描述:附带的 tar.gz 归档文件(APLA_BCM_version_0.5.3.tar.gz)包含以下文件: APLA.CDS.fna:基因组注释 v0.5.3 的 CDS 序列。 APLA.faa:基因组注释 v0.5.3 的氨基酸序列。 APLA.fna:基因组注释 v0.5.3 的 cDNA 序列。 APLA.Models.gff3:基因组注释 v0.5.3 中所有基因预测的 Gff3 格式文件。 APLA.Analysis.gff3:基因组注释 v0.5.3 中所有支持注释的证据的 Gff3 格式文件。
提供机构:
Ag Data Commons
5,000+
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54 个
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