CardioAtlas

CardioAtlas is a comprehensive scRNA-seq data resource and analysis platform that aggregates >3 016 000 cells across 27 human and 39 mouse cardiovascular datasets into 12 and 15 reference atlases (43 human and 39 mouse cell types), and provides five interactive modules—cell-type prediction, marker-gene identification, functional enrichment, regulon analysis, and cell-cell communication—plus upload-and-analyse functionality.CardioAtlas（心脏图谱数据库）是一款综合性的单细胞RNA测序（single-cell RNA sequencing, scRNA-seq）数据资源与分析平台，其整合了覆盖27个人类与39个小鼠心血管数据集的超301.6万个细胞，构建了12个人类与15个小鼠参考细胞图谱（涵盖43种人类细胞类型及39种小鼠细胞类型）；平台提供五大交互式分析模块，分别为细胞类型预测、标记基因鉴定、功能富集分析、调控元分析以及细胞间通讯分析，同时支持上传数据并开展自主分析的功能。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CardioAtlas是一个综合性的单细胞RNA测序数据资源与分析平台，专注于心血管组织和疾病研究。它整合了人类27个数据集和鼠类39个数据集，涵盖超过300万个细胞，构建了人类12个和鼠类15个参考图谱，覆盖了43种人类细胞类型和39种鼠类细胞类型。该平台提供六个交互式分析模块，支持细胞类型聚类、标记基因识别、功能富集、调控网络分析、细胞间通讯以及用户数据上传分析功能。