土壤病毒基因组数据库 (GSV)

Viruses are key mediators of soil microbial function and are an important component of soil ecosystems, yet existing studies of soil viromes are limited in spatial scale and biome coverage. Here, we present a comprehensive synthesis of soil virome biogeographic patterns based on the Global Soil Virome dataset (GSV) retrieved from 1,824 soil metagenomes across the globe. The GSV comprises 80,750 partial genomes of DNA viruses, of which 96.7% are taxonomically unassigned.

病毒是土壤微生物功能的关键介导因子，亦是土壤生态系统的重要组成部分。然而当前针对土壤病毒组（virome）的研究在空间尺度与生物群系覆盖范围上均存在局限。本研究依托从全球1824份土壤宏基因组（metagenome）中获取的全球土壤病毒组数据集（Global Soil Virome dataset, GSV），对土壤病毒组的生物地理分布模式开展了全面整合分析。该数据集包含80750条DNA病毒部分基因组，其中96.7%的序列未完成分类学注释。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

土壤病毒基因组数据库 (GSV) 是一个基于全球1,824个土壤宏基因组样本构建的综合性数据集，覆盖了广泛的空间尺度和生物群落。它包含80,750个DNA病毒的部分基因组，其中96.7%在分类学上未分配，突显了土壤中大量未知病毒的存在，为研究土壤病毒生态和功能提供了重要资源。