scATAC-Ref

We designed scATAC-Ref, a manually curated scATAC-seq database aimed at providing a comprehensive, high-quality source of chromatin accessibility profiles with known cell labels across broad cell types. Currently, scATAC-Ref comprises 1 694 372 cells with known cell labels, across various biological conditions, >400 cell/tissue types and five species.我们构建了scATAC-Ref，这是一款经人工整理标注的单细胞转座酶可及性测序（scATAC-seq）数据库，旨在提供覆盖广泛细胞类型、带有已知细胞标签的染色质可及性谱的全面高质量资源。目前，scATAC-Ref 共包含1694372个带有已知细胞标签的细胞，覆盖多种生物学状态、超过400种细胞/组织类型以及5个物种类群。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

scATAC-Ref是一个手动策划的单细胞ATAC-seq参考数据库，旨在提供多物种中带有已知细胞标签的染色质可及性图谱，涵盖超过400种细胞/组织类型和1,694,372个细胞。该数据库集成了基因活性评分、转录因子富集等分析功能，并通过用户友好界面支持查询和可视化，以促进细胞类型相关研究。