bgao95/SIU
收藏Hugging Face2024-06-13 更新2024-06-29 收录
下载链接：
https://hf-mirror.com/datasets/bgao95/SIU
下载链接
链接失效反馈官方服务：
资源简介：
该数据集用于训练gnn、cnn-3d、Uni-Mol和ProFSA等模型。数据集包含多个压缩文件，如gnn_cnn_data.zip、split_60.zip、split_90.zip和pretrain_weights.zip，分别用于不同版本的模型训练和预训练权重。数据集的主要文件格式为pickle格式的final_dic.pkl和lmdb格式的文件。final_dic.pkl文件中的每个键是一个uniprot id，对应的值是一个包含多个数据点的列表，每个数据点是一个字典，包含原子类型、配体构象、口袋原子类型、口袋原子位置、源数据信息、标签、配体的inchikey和smiles等键。lmdb格式的文件也包含相同的键。
该数据集用于训练gnn、cnn-3d、Uni-Mol和ProFSA等模型。数据集包含多个压缩文件，如gnn_cnn_data.zip、split_60.zip、split_90.zip和pretrain_weights.zip，分别用于不同版本的模型训练和预训练权重。数据集的主要文件格式为pickle格式的final_dic.pkl和lmdb格式的文件。final_dic.pkl文件中的每个键是一个uniprot id，对应的值是一个包含多个数据点的列表，每个数据点是一个字典，包含原子类型、配体构象、口袋原子类型、口袋原子位置、源数据信息、标签、配体的inchikey和smiles等键。lmdb格式的文件也包含相同的键。
提供机构：
bgao95
