木麻黄原始未组装基因组测序
收藏国家林业和草原科学数据中心2022-12-19 更新2024-03-06 收录
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资源简介:
为组装木麻黄基因组进行DNA文库构建,分别构建七个不同insert size的DNA测序文库 (250 bp, 450 bp, 500 bp, 800 bp, 2 kb, 5 kb, 和10 kb),进行Illumina HiSeq 2000 双端 DNA libraries 测序,分别获得44.36 G,60.23 G,22.45 G,9.58 G,5.47 G,16.06 G和5.93 G测序数据。
本研究为完成木麻黄基因组组装,构建了DNA测序文库:共制备7种不同插入片段长度(insert size)的文库,其插入片段尺寸分别为250 bp、450 bp、500 bp、800 bp、2 kb、5 kb及10 kb。随后采用Illumina HiSeq 2000平台对各双端DNA文库进行测序,分别获得44.36 G、60.23 G、22.45 G、9.58 G、5.47 G、16.06 G及5.93 G的测序数据量。
提供机构:
国家林业和草原科学数据中心
创建时间:
2022-12-19
搜集汇总
数据集介绍

背景与挑战
背景概述
该数据集包含木麻黄原始未组装基因组测序数据,通过Illumina HiSeq 2000平台对七个不同插入尺寸的DNA文库进行双端测序,总数据量达176.89 GB,旨在支持木麻黄基因组组装研究。数据集属于'国家重点研发计划项目',聚焦于林木次生生长的分子调控和环境胁迫机制,数据质量可靠,错误率低,适用于植物学相关分析。
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