Pln24NT 植物24-nt siRNA网络平台
收藏国家林业和草原科学数据中心2022-10-27 更新2024-03-06 收录
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https://www.forestdata.cn/dataDetail.html?id=CSTR:17575.11.0220221027251.040001.V1
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资源简介：
在植物中，24 个核苷酸的小干扰 RNA (24-nt siRNA) 占总 siRNA 库的很大比例，它们在指导植物特异性 RNA 指导的 DNA 甲基化 (RdDM) 中发挥重要作用，从而使转座子元件转录沉默、转基因、重复序列和一些内源基因。植物基因组中的几个基因座产生 24-nt RNA 的簇，这些基因座越来越受到研究界的关注。然而，目前没有专门用于 24-nt siRNA 基因座及其衍生的 24-nt siRNA 的生物信息学资源。因此，在本研究中，创建了 Pln24NT，一个免费可用的网络资源，以集中来自下一代测序（NGS ) 10 种流行植物物种的数据。还开发了一个直观的网络界面，方便搜索和浏览，并包含分析工具，帮助用户灵活地分析自己的 siRNA NGS 数据。 Pln24NT 将帮助植物研究界发现和表征 24-nt siRNA，并可能有助于研究 siRNA 在植物中 RNA 指导的 DNA 甲基化中的作用。
提供机构：
国家林业和草原科学数据中心
创建时间：
2022-10-27
