USDA-RDQMA

The goal of this project is to develop a general methodology for incorporating bacterial phylogenetics based on WGS into predictive models for infectious diseases using transformative and interdisciplinary research incorporating ecology, economics, molecular biology, and epidemiology. These methods and models will be applied towards better understanding the principles and dynamics governing transmission of mycobacterial infection.This work was supported by the USDA-NIFA AFRI [grant number # 2014-67015-2240] as part of the joint USDA-NSF-NIH-BBSRC-BSF Ecology and Evolution of Infectious Diseases program.

本项目的宗旨在于构建一种通用的方法论，该方法论旨在将基于全基因组测序的细菌系统发育学融入传染病预测模型中，通过跨学科研究融合生态学、经济学、分子生物学和流行病学等领域的先进研究成果。这些方法和模型将被应用于深入理解支配分枝杆菌感染传播的原理与动态。本研究项目得到美国农业部-国家食品和农业研究所（USDA-NIFA）AFRI项目[项目编号 # 2014-67015-2240]的支持，作为美国农业部-国家科学基金会（NSF）、美国国立卫生研究院（NIH）、英国生物技术与生物科学研究委员会（BBSRC）- 英国科学资助机构（BSF）联合举办的传染病生态与进化计划的一部分。