口腔肿瘤非编码 RNA 互作及靶点验证数据集

数据清洗：剔除ncRNA或靶基因ID无法匹配miRBase/Ensembl注释、互作证据等级低于"实验验证"及关键字段缺失的记录；删除测序 reads 数过低或表达量TPM＜1的弱信号条目。

标准化注释：将ncRNA及靶基因统一映射至miRBase v22和HGNC/Entrez Gene标准ID，互作类型（结合/降解/翻译抑制）、验证方法（双荧光素酶/RIP/CLIP）按受控词表编码赋值。

数据集构建：按肿瘤亚型、ncRNA类别、验证实验类型分类建表，关联互作自由能、结合位点及文献来源，最终整合成结构化口腔肿瘤ncRNA–靶标互作验证关系数据集（CSV/关系型数据库格式），并做去标识化处理。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集聚焦口腔肿瘤非编码RNA互作及靶点验证，经数据清洗（剔除低表达、低证据或无注释记录）、标准化注释（统一映射至miRBase v22及HGNC/Entrez Gene标准ID）后，按肿瘤亚型、ncRNA类别及验证实验类型结构化整合，形成CSV或关系型数据库格式。数据规模约100条，每周更新，主要应用于口腔肿瘤分子机制研究、早期诊断标志物筛选、靶向药物研发及疗效监测等场景。