20 Nematode Genomes - Part 2
收藏DataCite Commons2020-09-05 更新2024-07-25 收录
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资源简介:
Data for PhD thesis on "Next-generation Nematode Genomes" Sujai Kumar This tgz file is Part 2 of 20 Nematode genome nucleotide fasta files. The original files were obtained from WormBase (WS230),http://nematod.es, and www.inra.fr/meloidogyne_incognita/genomic_resources The fasta files have been cleaned up: a) multi-line sequences have been converted to single line b) sequence IDs have been prefixed with a species abbreviation: Caenorhabditis elegans (ce) Caenorhabditis japonica (cj) Caenorhabditis angaria (ca) Pristionchus pacificus (pp) Meloidogyne floridensis (mf) Meloidogyne incognita (mi)
本数据集为Sujai Kumar所撰写的题为《下一代线虫基因组》的博士学位论文所用数据。本tgz压缩包为20份线虫基因组核苷酸FASTA(FASTA)格式文件中的第2部分。原始文件获取自WormBase(WS230版本)、http://nematod.es 以及www.inra.fr/meloidogyne_incognita/genomic_resources。
已对该批FASTA格式文件进行如下预处理:
a) 将多行序列整合为单行格式;
b) 为序列ID添加物种缩写前缀,对应关系如下:
1. 秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans,ce)
2. 日本隐杆线虫(Caenorhabditis japonica,cj)
3. 安加隐杆线虫(Caenorhabditis angaria,ca)
4. 太平洋瓣结线虫(Pristionchus pacificus,pp)
5. 佛罗里达根结线虫(Meloidogyne floridensis,mf)
6. 南方根结线虫(Meloidogyne incognita,mi)
提供机构:
figshare创建时间:
2016-01-11
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