scEccDNAdb
收藏知名数据库2026-06-11 收录
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scEccDNAdb houses 3.19 million eccDNA events detected from single-cell whole-genome sequencing of human and mouse samples, richly annotated with oncogenes, enhancers, TF-binding sites, SNPs and more, and offers nine online analysis/visualisation tools plus BLAST and genome-browser modules.
scEccDNAdb 数据库收录了从人类和小鼠样本的单细胞全基因组测序中检测到的319万个环状染色体外DNA（extrachromosomal circular DNA, eccDNA）事件，其注释信息丰富，涵盖癌基因、增强子、转录因子结合位点（TF-binding sites）、单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism, SNPs）等多类内容，并提供九款在线分析与可视化工具，以及BLAST和基因组浏览器模块。
提供机构：
西南交通大学搜集汇总
数据集介绍
背景与挑战
背景概述
scEccDNAdb是一个单细胞水平的全面eccDNA数据库，基于现有单细胞全基因组测序数据构建，目前包含人类和小鼠的约319.5万个eccDNA事件。该数据库提供详细的注释信息和九种在线分析工具，支持用户上传自定义文件进行eccDNA研究。
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