PlantsP

Here, we describe the identification of more than 300 phosphorylation sites from Arabidopsis thaliana plasma membrane proteins.We present an analysis of the characteristics of phosphorylation sites, their conservation among orthologs and paralogs, and the existence of putative motifs surrounding the sites. These analyses yield general principles for predicting other phosphorylation sites in plants and provide indications of specificity determinants for responsible kinases.All data are deposited in a new searchable database for plant phosphorylation sites maintained by PlantsP (http://plantsp.sdsc.edu)本研究报道了从拟南芥（Arabidopsis thaliana）质膜蛋白（plasma membrane proteins）中鉴定出的300余个磷酸化位点（phosphorylation sites）。本研究对这些磷酸化位点的特征、其在直系同源物（orthologs）与旁系同源物（paralogs）间的保守性，以及位点周围推定基序（putative motifs）的存在情况进行了系统分析。这些分析提炼出了可用于预测植物中其他磷酸化位点的通用规律，并为解析相关激酶（kinases）的特异性决定因子提供了重要线索。所有数据均已存入由PlantsP维护的全新植物磷酸化位点可搜索数据库（http://plantsp.sdsc.edu）

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集专注于植物磷酸化位点研究，通过鉴定拟南芥质膜蛋白的300多个磷酸化位点，分析其保守性和基序特征，为预测植物磷酸化位点和激酶特异性提供基础，并已整合至PlantsP公开数据库中。