2017-2018年土壤样品中可培养细菌16SrRNA数据集

可培养细菌16S rRNA和recA基因序列信息。将细菌菌株接种至NA液体培养基上，37?C，180rpm培养12h后，12000rpm，4℃离心10min，收集菌体并提取细菌基因组DNA（Fast TIANamp Bacteria DNA Kit）。以提取的细菌DNA为模板，用细菌16S rRNA通用引物27F/1492R进行扩增（27F 5′-AGA GTTTGATCCTGGCTCAG-3′，1492R 5′-ACGGCTACCTTGTTACGACTT-3′），扩增体系为25μL：DNA模板 2μL，10×PCR buffer 2.5μL，Mg2+ buffer 2μL，dNTP (10 mM ) 2μL，27F 1μL，1492R 1μL，Taq酶 1μL，ddH2O 13.5μL；扩增程序为：95?C预变性 5min，95?C变性 60s，49?C 退火30s，72?C延伸 30s；共35个循环，72?C延伸10min。PCR产物由上海生工生物工程有限公司测序。