来自瑞典城市湖泊的宏基因组数据集

城市湖泊在影响生活质量的同时，为社会提供了多种好处。此外，湖泊及其微生物组是人为影响的哨兵，可用于自然资源管理和规划。在这里，我们发布了来自斯德哥尔摩（瑞典）附近几个特征明确且受人为影响的富营养化湖泊的原始宏基因组数据。我们的目标是收集具有代表性的微生物群落样本，并使用鸟枪法测序来提供关于生产性城市湖泊微生物多样性的广泛视图。我们的数据集强调梅拉伦湖是受人为影响的主要饮用水库。该数据集包括从大斯德哥尔摩地区附近的富营养化湖泊收集的 17 个样本中的每一个样本的短读长序列数据和宏基因组组装。我们使用基因组分辨的宏基因组学，获得了 2378 个宏基因组组装的基因组，这些基因组去复制成 514 个物种代表性基因组。该数据集为先前测序的湖泊添加了新的数据点，它包括来自 Mälaren 湖的第一组测序宏基因组。我们的数据集可作为未来饮用水水库和城市湖泊监测的基线。